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R语言自学笔记三:基本数据管理

4.1 一个示例 一个数据集中可能含有几十个变量和成千上万的观测,但为了简化示例,我们仅选取了5行10列的数据可以使用代码清单4-1中的代码创建一个包含表4-1中数据的数据框。 manager <- c(1, 2, 3, 4, 5) date <- c("10/24/08","10/28/08","10/1/08","10/12/08","5/1/09") country <- c("us","us","us","uk","uk") gender <- c("M","M","F","F","…

2023年4月1日 0条评论 2280点热度 2人点赞 MSxiaoming 阅读全文
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R语言自学笔记二:图形初阶

1 使用图形 通过逐条输入语句构建图形,逐渐完善图形特征,直至得到想要的效果。 如下 attach(mtcars) plot(wt, mpg) abline(lm(mpg-wt)) title("Regression of MPG on weight") detach(mtcars) 以上代码首句绑定了数据框mtcars。第二条语句打开了一个图形窗口并生成了一幅散点图,横轴表示车 身重量,纵轴为每加仑汽油行驶的英里数。第三句向图形添加了一条最优拟合曲线。第四句添加了标题。最后一句为数据框解除了绑定。 要通过代码保存…

2023年3月29日 0条评论 2394点热度 1人点赞 MSxiaoming 阅读全文
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R语言自学笔记一:数据集及其处理

探索R中的数据结构 数据集的概念: 数据集通常是由数据构成的一个矩形数组,行表示观测,列表示变量。表2-1提供了一个假想的病例数据集。 在表2-1所示的数据集中,PatientID是行/实例标识符,AdmDate是日期型变量,Age是连续型变量, Diabetes是名义型变量,Status是有序型变量。 R可以处理的数据类型(模式)包括数值型、字符型、逻辑型(TRUE/FALSE)、复数型(虚数)和原生型(字节)。 数据结构 R中有许多用于存储数据的结构,包括标量、向量、数组、数据框和列表。 在R中,对象(obje…

2023年3月27日 0条评论 2459点热度 4人点赞 MSxiaoming 阅读全文
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温故知新:基于R语言的群体药代动力学数据探索

@TOC 一 、群体药代动力学数据探索目的和方法 数据探索目的 建模前通过图法和统计学方法,对研究数据探索可揭示数据特征,发现明显趋势,辨识离群值,异常值等。 数据来源 数据来自于焦正主编的基础群体药动学和药效学书籍第10章第二节模型数据 方法 作图主要用ggplot2包,及代码中涉及的包。 作图所用主题为ggplot2默认主题:theme_bw() 稍调整 二、数据探索过程 PK数据探索 加载的包和设目录 代码: #加载的包---- library(ggplot2) library(dplyr) library(…

2023年3月10日 0条评论 2363点热度 0人点赞 MSxiaoming 阅读全文
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R语言笔记:群体药动学数据探索

用到的包 library(dplyr) library(ggplot2) library(gridExtra) 加载资源 source("D:\\工作文档\\R\\col_function.r") 设置工作目录 setwd("C:\\Users\\Administrator.ADMIN-20170618T\\Documents\\demo-data\\PPK\\iv infusion 3cp") 读取数据 #read data---- SDTAB<-read.table("SDTAB1",sep="",ski…

2023年3月10日 0条评论 2021点热度 1人点赞 MSxiaoming 阅读全文
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第6章 常用群体药动学模型评价方法:诊断图

诊断图 分类: 绘制诊断图是最为常见的一种模型评价方法,适用于基础模型和最终模型的比较与 评价。总体而言,模型诊断图可根据不同变量分为以下几种: 1. 基于预测的模型诊断图 2. 基于残差的模型诊断图 3. 基于贝叶斯估算的模型诊断图 不同的诊断图从不同的视角评估模型的准确性与适用性,反映了模型化过程中的模 型设定错误、违背随机变量分布假设以及离群值等问题。这些诊断图可并行比较,描述纳 入协变量前后模型的改善情况,以指导模型的开发与优化过程。 基于预测的模型诊断图 呈现实际观测值与群体、个体预测值的一致性,反映模型…

2023年3月10日 0条评论 2333点热度 2人点赞 MSxiaoming 阅读全文
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建模与模拟方法在预测儿科人群治疗性单克隆抗体药代动力学中的应用 儿科患者单克隆抗体的药代动力学和临床药理学 生理学的药代动力学建模的基本概念 PBPK相关指导原则 文献阅读:一种机制的儿童清除率缩放方法 《儿童用药(化学药品)药学开发指导原则》解读
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自学笔记:CAR-T疗法及其药物的PK,PD特征 儿科患者单克隆抗体的药代动力学和临床药理学 如何优化 PBPK 模型? PBPK模型:案例1-机制探讨并预测人体PK GastroPlus DDI模块界面和操作 第5章 第二节NONMEM基础模型

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