一、实验步骤 1. 准备检测试剂 将冻干 Luciferin Detection Reagent 和对应 Reconstitution Buffer 平衡至室温。 将整瓶重溶液加入冻干试剂瓶，轻轻颠倒混匀，并标注 CYP/底物名称。 CYP2C19/H EGE、CYP2D6/ME EGE、CYP3A4/IPA 使用含 esterase 的重溶液。 CYP1A2/1A2 和 CYP2B6/2B6 额外加入 d-Cysteine。 重溶试剂室温可放置约 24 小时，4°C 可放置约 1 周；避免反复冻融。 2. 准备底…
摘要 本笔记根据 Easton Henderson 于 2026 年 1 月 12 日发表的英文综述《Mastering the Michaelis-Menten Equation》整理。文章从 E + S ⇌ ES → E + P 出发，串起公式推导、实验测定、非线性拟合、抑制剂分析和药物发现应用。下面按“理论 → 实验 → 拟合 → 机制解释 → 排错”的顺序改写，便于直接作为实验清单使用。 原文：Mastering the Michaelis-Menten Equation: A Comprehensive …
这篇综述的核心问题是：TCR-T 细胞治疗进入人体之前，临床前证据应该怎样搭起来，哪些环节现在仍然不够可靠。作者把 TCR-T 的开发拆成三段：生产技术开发、有效性评估和安全性评估。每一段都有常规实验可以做，但也都有一个共同限制：TCR-T 识别的是特定 HLA 呈递的肽，因此很多风险很难用普通动物模型完整复现。 TCR-T 与 CAR-T 的差异决定了它的临床前路径。CAR-T 主要识别细胞表面抗原；TCR-T 识别 MHC/HLA 呈递的肽，因而能覆盖更多胞内抗原，更适合一部分实体瘤场景。问题也更直接：HLA …
这篇 Trends in Pharmacological Sciences 的观点文章，核心问题很明确：bispecific T cell engager（bsTCE）已经进入多个血液肿瘤适应症，但它的开发难点并不只在“分子能不能桥接 T 细胞和肿瘤细胞”。真正困难的是如何在复杂免疫背景下理解疗效、CRS 风险、FIH 起始剂量、step-up 给药、RP2D 选择，以及长期复发和耐受性。 作者的主张是：QSP 可以成为 bsTCE 开发中的机制型决策工具。它可以把分子结合、trimer formation、T 细…
这篇 Scientific Reports 文章讨论的是一个三特异性 T cell engager（TCE）的剂量-效应问题。 研究对象是复发/难治性多发性骨髓瘤（RRMM）中的 CD3-CD28-CD38 trispecific TCE。它同时结合 T 细胞上的 CD3、T 细胞共刺激受体 CD28，以及骨髓瘤细胞相关靶点 CD38。作者用体外实验和 rule-based QSP 模型结合，解释为什么加入 CD28 臂后，trispecific TCE 的剂量-效应关系可能不同于典型 bispecific TCE…
这篇 2025 年 npj Systems Biology and Applications 文章，讨论的是一个很实际的开发问题：在复发/难治性弥漫大 B 细胞淋巴瘤（R/R DLBCL）中，能否用 QSP 模型提前判断 CD19 ADC loncastuximab tesirine 与 CD20/CD3 T-cell-dependent bispecific antibodies（TDBs）联合给药的疗效、给药周期、剂量下调空间，以及细胞减少患者是否仍可能获益。 文章的核心不是重新发明一个大型肿瘤免疫模型，而是把…
T cell engager（TCE）在实体瘤中的开发难点，不只是“能不能把 T 细胞拉到肿瘤细胞旁边”。 真正影响疗效的是一组联动因素：肿瘤抗原表达、CD3 结合、T 细胞浸润、Treg 抑制、肿瘤生长速度、抗体暴露，以及这些因素最终能否在肿瘤局部形成足够稳定的 TCE-肿瘤细胞-T 细胞三元复合物。 这篇 AAPS Journal 文章建立了一个用于实体瘤 TCE 治疗的 quantitative systems pharmacology（QSP）模型。模型以既有的全身肿瘤免疫 QSP 模型为基础，加入 CEA…
参数、公式、标签与关键字 本节详细描述了在 MoBi 中进行模型构建时如何使用重要概念。 首先，解释不同类型的参数及其属性。 然后，描述不同类型公式的使用。公式用于定义参数、反应动力学、运输过程、观察器方程和分子初始条件。 接下来是标签概念的解释。标签广泛用于定义观察器、运输过程、事件、参数的定位条件，以及求和公式。 最后，列出了可在路径中用于定义公式引用的特殊关键字。 参数 功能概览 在所有构建单元中，可能需要创建和编辑参数。参数通常列在名为"Parameters"（参数）的单独选项卡视图中。参数用于描述分子、反…
个体（Individuals） 个体构建单元（BB）包含描述生理学的物种特异性和个体特异性参数。表达谱是定义个体生理特性的参数路径和值的列表。 具体而言，个体 BB 包含的参数具有以下特征： 仅存在于特定物种中：例如 Organism|Lumen|Duodenum|Thickness_p1 仅存在于人类物种中，但不存在于大鼠中；而 Organism|Lumen|Duodenum|Default thickness of gut wall 则存在于大鼠中但不存在于人类中。 具有不同的物种特异性值：例如 Organis…
表达谱（Expression Profiles） 表达谱构建单元（BB）包含蛋白质的表达和定位信息。表达谱是一组参数路径和值的列表，用于定义蛋白质的表达，以及蛋白质分子在不同隔室中的初始条件。 从 PK-Sim 导入 PBPK 模型时，PK-Sim 模型中定义的每个蛋白质都会创建一个新的表达谱 BB。 与其他构建单元类型不同，表达谱 BB 不是模块的一部分，而是存储在 MoBi 项目浏览器的独立文件夹中。它们可以与项目的任何模块组合使用。如果模块不包含表达谱中定义的蛋白质，则该表达谱对模拟没有影响。 表达谱 — 功…
初始条件（Initial Conditions） 初始条件（IC）构建单元（BB）定义了分子将要存在的容器以及它们的初始量。 以下章节描述了在从 PK-Sim 导出的 PBPK 模型上 IC BB 的各项功能。随后，通过一个简单的示例演示如何创建新的 IC BB 并填充信息。 初始条件 — 功能概览 IC BB 可以包含跨不同模块的物理容器中分子的条目。 与其他构建单元类型（参数值 BB 除外）不同，多个 IC BB 可以在一个模块内创建。这允许您为不同的模拟场景定义不同的初始条件。例如，内源性分子的不同初始浓度可…
参数值（Parameter Values） 参数值（PV）构建单元（BB）定义了模拟结构中各种参数的值。默认情况下，PV BB 应仅包含与参数定义所在构建单元中的默认值不同的值。 PV BB 还可以在模拟创建过程中创建新参数。 以下章节描述了 PV BB 的各项功能。随后，通过一个简单的示例演示如何创建新的 PV BB 并填充信息。 参数值 — 功能概览 与其他构建单元类型（初始条件 BB 除外）不同，多个 PV BB 可以在一个模块内创建。这允许您为不同的模拟场景定义不同的参数化方案。例如，不同的参数集可以代表不…
