MoBi® 参数、公式、标签与关键字：模型构建核心概念全面详解

2026年8月19日 9点热度 0人点赞 0条评论

参数、公式、标签与关键字

本节详细描述了在 MoBi 中进行模型构建时如何使用重要概念。

首先，解释不同类型的参数及其属性。

然后，描述不同类型公式的使用。公式用于定义参数、反应动力学、运输过程、观察器方程和分子初始条件。

接下来是标签概念的解释。标签广泛用于定义观察器、运输过程、事件、参数的定位条件，以及求和公式。

最后，列出了可在路径中用于定义公式引用的特殊关键字。

参数

功能概览

在所有构建单元中，可能需要创建和编辑参数。参数通常列在名为"Parameters"（参数）的单独选项卡视图中。参数用于描述分子、反应或运输、空间结构、事件或给药的物理或生理特性。

为了提高可读性，参数分为两类："常规"（regular）参数和"高级"（advanced）参数。在任何参数列表上方，都有一个名为 Show Advanced Parameters（显示高级参数）的复选框。如果取消勾选此框，标记为"高级"的参数将被隐藏。在创建或编辑参数时，通过勾选 Advanced Parameter（高级参数）框，可以将任何参数标记为"高级"。

参数可以创建、复制、移动、编辑或从 pkml 文件加载：

通过点击参数选项卡视图中存在的 Add Parameter（添加参数）按钮添加参数，或者在树形、列表或图表视图中右键点击构建单元项的名称（分子、反应等），从弹出的上下文菜单中选择 Create Parameter（创建参数）。
除了创建参数外，还可以从文件加载参数。使用 Load Parameter（加载参数）按钮或上下文菜单项，选择一个已包含合适参数的 pkml 文件（例如之前保存的构建单元、模块或模拟）。
第三种选择是在构建单元项之间复制和粘贴参数：选择一个参数，按 Ctrl+C 复制，移动到目标区域后点击空白参数空间，按 Ctrl+V 粘贴。除了用 Ctrl+C 复制参数外，还可以用 Ctrl+X 从当前位置剪切参数。

在不同构建单元中，操作流程和可选选项略有差异，将在本章相应章节中说明。在分子和反应构建单元中，参数可以是 Local（局部）和 Global（全局）类型。

全局参数被视为分子或反应的属性，不依赖于分子或反应的位置（例如分子的"Molecular Weight"分子量，或反应速率常数）。这些参数列在模拟树根目录下的分子/反应节点中，通过路径 <MOLECULE/REACTION>|<parameter name> 访问，例如 Cimetidine|Molecular weight。
局部参数是其值依赖于分子或反应位置的参数，例如分子的"Concentration"（浓度），或依赖于抑制剂浓度的表观 KM,app（参见 PK-Sim - 定义抑制/诱导过程）。这些参数列在模拟树中每个容器下的分子或反应节点中，通过路径 <ContainerPath>|<MOLECULE/REACTION>|<parameter name> 访问，例如 Organism|VenousBlood|Plasma|Cimetidine|Concentration 或 Organism|Liver|Periportal|Intracellular|Midazolam-CYP3A4-Metabolization|Km_app。

任何参数都有一个维度（Dimension），其值可以用不同的单位（Units）表示。所有支持的维度列表见附录 A.1。

在公式中使用参数时，值始终在内部转换为该维度的基础单位。例如，如果维度为"Concentration (molar)"的参数以"nmol/l"单位定义，在公式中使用时其值将转换为"µmol/l"。

可以通过从下拉列表中选择预定义组来将参数分配到某个组（Group）。此信息仅用于显示目的。在参数树形视图中勾选 Group parameters（分组参数）框，参数将按其分配的组名分组显示。

无法创建新组。可用组列表是预定义的，不能更改。

在 Formula Type（公式类型）下拉框中，可以选择参数的定义方式：

常数（constant）：由数值和单位组成；
表格（table）：使用独立的数据对，在模拟时间内对值进行插值；
公式（formula）：具有公式名称和公式字符串（即数学表达式），包含对公式项的引用；
带偏移的表格（table with offset）：一个表格被复用并按另一个参数中定义的常量时间值进行时间偏移；
带 X 参数的表格公式（table formula with x-argument）：一个表格被复用并按另一个参数中定义的值进行求值；
求和公式（sum formula）：计算满足特定条件的所有值之和；
计算方法（calculation method）参数：其公式将根据模型中每个分子选择的计算方法来定义（仅适用于空间结构容器的参数）。计算方法不能在 MoBi® 内编辑，从 PK-Sim® 导入。
分布（distributed）值：围绕常量值或在两个极限之间分布（仅适用于空间结构容器的参数）。

不同公式类型在"公式"章节中解释。

在 Create（创建）或 Edit（编辑）窗口的底部，有几个输入选项对参数产生不同效果：

勾选 Parameter is state variable（参数为状态变量）将打开微分方程右边的额外输入字段（详见"状态变量参数"章节）。
勾选 Plot Parameter（绘制参数）将标记此参数，使其可在模拟结果图表中可视化（参见图表组件）。
勾选 Advanced Parameter（高级参数）将在参数列表视图中取消勾选 Show Advanced Parameters 时隐藏此参数。
对于所有参数类型，可以在底部的输入框中添加描述，例如引用参考文献。点击文本字段将打开编辑对话框，可输入或粘贴任意文本。

还可以在参数编辑器的 Tags（标签）选项卡中为任何参数添加标签。标签用于标记参数以便在求和公式中进行选择性计算（参见"求和公式"）。标签的使用方法在"标签的使用"中解释。

要添加标签，点击"Add Tag"（添加标签）按钮并在输入框中输入标签。
要删除标签，点击列表中每个标签后面出现的符号。

常数参数

常数参数由常量值（Value）定义。可以使用小数点、指数表示法和减号（例如 2.34；1.2E-6；-150）。值旁边显示其单位；默认单位由维度字段中的选择决定，但可以更改为下拉框中列出的其他单位，例如从 1/min 改为 1/sec 或 1/h。

常数参数的例子包括分子的"Molecular weight"（分子量）或反应的速率常数。

分布参数

分布参数（仅适用于空间结构容器的参数）描述围绕常量值或在两个数值极限之间的变异。在给定的 MoBi® 模拟中，分布参数具有固定值（默认由 value 字段中的值定义）。分布参数只能用于计算给定分布下参数值的百分位数。分布参数适用于需要在模型中定义种群统计数据的情况。要定义此类参数，使用空间结构项（如容器（例如器官大小）或邻域（例如血流速率））的上下文菜单中的 Create Distributed Parameter（创建分布参数）命令。除了常数参数需要输入的内容外，还必须选择 Distribution Type（分布类型）。可用选项包括：

离散分布（Discrete Distribution）：与常数参数相同。此功能的目的是简单地禁用分布函数，而无需重新执行参数创建过程。
均匀分布（Uniform Distribution）：参数在最小值（Minimum）和最大值（Maximum）之间均匀分布。
正态分布（Normal Distribution）：参数值呈正态分布（高斯分布），具有均值（Mean）和标准差（Standard Deviation）。
对数正态分布（LogNormal Distribution）：参数值服从对数正态分布，具有均值（Mean）和几何标准差（Geometric Standard Deviation）。

如果使用上述分布之一，将根据定义的分布自动为 value 字段中定义的参数值计算百分位数。

状态变量参数

参数也可以定义为具有右边（RHS）的状态变量。这意味着参数值由微分方程定义。为此，在输入或编辑参数时勾选 Parameter is state variable（参数为状态变量）复选框。

例如，参数 p 的值由微分方程定义：

dp/dt = RHS

其中 RHS 是定义每时间步参数值变化量的微分方程右边。

对于状态变量参数，可以在参数编辑视图的上半部分定义参数的初始值，与其他参数类型相同。初始值是模拟时间 = 0 时的参数值。

右边（Right Hand Side）在编辑器的底部定义。参数值根据微分方程在每个模拟步骤中求值。

一旦取消勾选 Parameter is state variable 复选框，RHS 的输入框将消失。参数不再是状态变量，右边（RHS）公式恢复为 RHS = 0。如果意外取消了复选框然后重新勾选，之前定义为 RHS 的公式不会丢失，因为所有创建的公式都已存储。要恢复之前定义为 RHS 的公式，在选择了公式类型"explicit formula"（显式公式）后从下拉框中选择该公式。

对于状态变量参数，参数值构建单元中定义的值表示模拟时间 = 0 时参数的初始值。

公式

功能概览

公式在 OSP 模型中广泛用于定义参数、反应动力学、运输过程、观察器方程和分子初始条件。本节描述如何在 MoBi® 中使用公式。

在构建单元中定义的所有公式列在名为 Formulas（公式）的单独选项卡中。点击列表中的公式将显示所选公式的引用和方程。右键点击列表中的公式会打开上下文菜单，允许重命名（Rename）、克隆（Clone）和删除（Remove）公式。

公式可以复用，例如空间结构中的多个参数可以使用同一公式。

注意：如果在参数或任何其他实体的编辑器中修改了公式，此更改将影响使用该公式的所有其他实体！

可以通过复制和粘贴在不同构建单元之间复用公式。为此，在构建单元的公式列表中选择一个公式，按 Ctrl+C，然后移动到另一个构建单元的公式列表并按 Ctrl+V。

创建公式时，它获得创建位置参数或实体的维度。对于参数，公式获得参数的维度。对于分子起始值，维度为"Amount"（量）。对于反应和运输过程动力学，维度为"Amount per time"（量/时间），用于事件条件的公式维度为"Dimensionless"（无量纲）。更改公式维度的唯一方法是更改分配该公式的参数或实体的维度。此外，公式只能在具有相同维度的实体或参数中使用。

建议使用与公式使用对象相关的名称（例如参数、反应、观察器）——甚至可以使用相同名称。

要输入或编辑公式字符串，点击 Description（描述）字段上方未命名的输入框，然后使用键盘输入。此公式字符串将在运行模拟时由求解器求值。它写成包含数值、算术运算符和参数名称或别名的数学项。只要公式有错误或不完整，空输入框左侧就会显示红色错误标志。将鼠标悬停在此警告符号上会显示关于方程有效性的工具提示（例如缺少引用或语法错误）。

公式中支持的字符和函数

在（显式）公式中，可以使用以下字符：

数字可以按常数的描述输入，例如 2.34；1.2E-6；-150（警告：逗号 , 被解释为小数点！）
TIME 变量：模拟时间
算术运算符：
- 加 +，例如 3 + 5
- 减 -，例如 3 - 5 或 -5（一元负号）
- 乘 *，例如 3 * 5
- 除 /，例如 3 / 5
- 幂 ^，例如 3^5 = 3 的 5 次方
圆括号 ( )，例如 (3 + 5) * 2
常量 pi 和 e，分别代表数学常数 π 和 e。
数学函数：
- 反余弦 ACOS，例如 ACOS(0.5)
- 反正弦 ASIN，例如 ASIN(0.5)
- 反正切 ATAN，例如 ATAN(1)
- 余弦 COS，例如 COS(pi/4)
- 双曲余弦 COSH，例如 COSH(1)
- 指数函数 EXP，例如 EXP(1) 等于 e^1
- 自然对数 LN 或 LOG，例如 LN(e) 或 LOG(e)
- 以 10 为底的对数 LOG10，例如 LOG10(10)
- 两值最大值 MAX，例如 MAX(3;5) 结果为 5
- 两值最小值 MIN，例如 MIN(3;5) 结果为 3
- 幂函数 POW，例如 POW(3;5) 等于 3^5
- 正弦 SIN，例如 SIN(pi/4)
- 双曲正弦 SINH，例如 SINH(1)
- 平方根 SQRT，例如 SQRT(4)
- 正切 TAN，例如 TAN(pi/4)
- 双曲正切 TANH，例如 TANH(1)
随机数生成函数 RND 和 SRND，均使用虚拟参数 ()：
- RND 每次运行程序时会产生 [0..1] 区间内相同的随机数序列，因为它从默认种子开始。
- SRND 会产生"真正的"随机数。如果在任何模型中调用了 SRND，所有其他对 RND 的调用（在本模型和所有其他模型中！）都将产生"真正的"（不可重现的）随机数——直到重启 MoBi 或 PK-Sim！

上述数学函数按 C 编程语言的定义。

此外，定义的别名可用作公式中的公式常量。

公式别名——在公式中使用其他参数和分子量

下图展示了创建或编辑公式时打开的公式编辑器窗口。

在公式名称下方和公式字符串上方，有一个引用表（Reference Table），显示名为 Alias（别名）、Path（路径）和 Dimension（维度）的列标题。引用表右侧有第二个名为 References to add（待添加引用）的表格。通过拖放将引用从右侧移动到左侧的引用表中。

别名（Alias）是在公式字符串中用于引用对象的名称。
路径（Path）是引用对象（参数或分子量）的路径。

例如，在公式 3 * Conc + 5 中，别名是 Conc，路径可能是 Organism|Liver|Plasma|Cimetidine|Concentration。

通过拖放向公式添加引用时，可以选择绝对路径或相对路径。如果选择相对路径，系统会要求选择一个局部参考点（local reference point）。局部参考点是模型结构中定义相对路径的起始位置。可以将其视为工作目录，所选实体的路径将相对于它构建。有关绝对路径和相对路径的更多信息，请参见"路径概念"章节。

所选的局部参考点以其绝对路径显示在"References to add"窗口中。如果需要更正或更改局部参考点，点击路径右侧的 ... 图标，将重新打开参考点选择窗口。

选择参考点后添加引用的步骤：

在 Possible Referenced Objects（可选引用对象）树中按名称查找引用。必要时展开树节点。
点击对象名称，然后将其拖到左侧的引用表区域；释放鼠标按钮即可放置。对象将被添加到列表中，通常以其名称作为别名。如果该名称已存在于列表中，别名会自动添加运行索引。对象的路径和维度也会被添加。

并非树中的所有条目都允许移到左侧，这取决于公式的上下文。

如有需要，可以手动编辑对象的别名。别名需要与公式字符串中使用的名称一致。只需点击别名即可更改或覆盖（或复制/粘贴）名称。例如，如果将不同分子的多个"Concentration"参数添加到反应动力学方程中，手动添加分子名称可能会有所帮助。
与别名一样，也可以手动编辑路径。但标准做法是移除对象并使用新的局部参考点重新添加。
可以通过点击显示的维度并从下拉框中选择不同维度来更改维度。

要从引用列表中移除对象，右键点击它并从上下文菜单中选择 Remove（移除）。

公式中的条件

可以在公式中使用逻辑条件来根据条件的满足情况定义不同的值。

条件使用 <condition> ? <value1> : <value2> 表示法定义，例如 TIME < 10 ? 5 : 10，意思是"如果时间小于 10，使用值 1，否则使用值 2"。条件中支持以下运算符：

小于 < 或 LT，例如 TIME < 10 或 LT(TIME;10)
大于 > 或 GT，例如 TIME > 10 或 GT(TIME;10)
不等于 <> 或 != 或 NEQ，例如 TIME <> 10 或 TIME != 10 或 NEQ(TIME;10)
大于等于 >= 或 GEQ，例如 TIME >= 10 或 GEQ(TIME;10)
小于等于 <= 或 LEQ，例如 TIME <= 10 或 LEQ(TIME;10)
等于 = 或 EQ，例如 TIME = 10 或 EQ(TIME;10)

条件可以通过 AND 和 OR 组合，或通过 NOT 取反。AND 的替代符号是 &；OR 的替代符号是 |。除了逻辑条件外，数字 0 和 1 也可用作参数，其中 0 表示 false，1 表示 true。

如果公式定义的实体值预期会根据条件满足情况发生变化，建议使用事件而非公式中的"if 条件"。

求和公式

求和公式可用于计算满足特定条件的实体值之和。条件由分配给实体的标签定义。标签可以分配给容器、邻域、参数和事件（参见"标签的使用"）。

表格公式

参数可以由模拟时间与对应函数值的数据对组成的表格定义。模拟中使用的参数值（时间函数）将在这些值之间进行插值。输入表格的步骤：

选择 Table（表格）作为 Formula Type（公式类型）。
要创建新表格公式，点击 Add Formula（添加公式）按钮，系统会要求输入公式名称。然后按 Enter 或点击 OK 返回主窗口。
在 Formula Name（公式名称）下拉框中，也可以选择现有的表格公式名称。
要添加数据点，点击 Add（添加）按钮。
输入时间-值对。值必须使用列标题中显示的单位。
如果求解器在到达这些时间点时产生错误，可以勾选 Restart Solver（重启求解器）框。

表格中的每个点都会在参数导数中产生不连续性。在多数情况下，ODE 求解器通过内部重启来处理。但在某些情况下，求解器无法自动处理此类导数不连续性，用户需要手动启用 Restart Solver 属性。

可以通过再次点击 Add Value Point（添加值点）或点击值行右侧的按钮来输入更多数据点。可以通过点击删除按钮来删除数据对。

或者，可以通过点击 Import（导入）按钮从 Excel 或 CSV 文件导入表格。导入过程与导入观测数据相同（参见"导入观测数据"）。

如果需要使用插值的一阶导数，勾选 Use Derivative Values（使用导数值）。序列第一个和最后一个数据点之前和之后的值设为 0。

带偏移的表格公式

表格可能需要复用并按常量时间值偏移。例如，PK-Sim® 使用此逻辑来构建重复的高级给药方案（参见 PK-Sim® - 给药方案）。

对于带偏移的表格公式，需要指定：

表格参数：Path to table object（表格对象路径）。点击"..."图标可从路径树中选择现有表格参数。
偏移时间参数：path to offset object（偏移对象路径）。点击"..."图标可从路径树中选择一个此类对象。此对象必须是维度为 Time 的参数。

偏移参数的值将在求值时从原始表格的 X 值中减去。

带 X 参数的表格公式

如果表格需要描述值依赖于模拟时间以外其他参数的参数，可以使用带 X 参数的表格公式。

对于带 X 参数的表格公式，需要指定：

表格参数：Path to table object（表格对象路径）。点击"..."图标可从路径树中选择现有表格参数。
用作 X 参数的对象路径。

所选 X 参数的值将在求值时用作原始表格中的 x 值。值被认为以基础单位表示。

标签的使用——公式、观察器、运输和事件的容器条件

空间结构中的容器和邻域、给药元素或参数可以用标签标记。这些标签连同容器或邻域的名称，可用于选择性地启用观察器、主动或被动运输或事件。它们用于"求和"类型公式的公式求值。

标签可在创建或编辑携带标签的实体时输入。详细步骤在本章描述空间结构、观察器、事件或参数的相应章节中说明。通常，在对应实体的特殊输入窗口中输入一个或多个名称。

条件在观察器、运输或事件组中标题为"In Container with"（在容器中）或"Between Containers with"（在容器之间）的字段中求值。条件可以使用 AND 逻辑（Condition1 AND Condition2 AND ...）或 OR 逻辑（Condition1 OR Condition2 OR ...）组合。

设想以下简单的模型结构：

Organism (逻辑)
  |
  +-- Container A (逻辑)
  |      |
  |      +-- Container A1 (物理)
  |      +-- Container A2 (物理)
  |
  +-- Container B (逻辑))
         |
         +-- Container B1 (物理)
         +-- Container B2 (物理)

分子 Molecule A 存在于物理容器 A1、A2、B1 和 B2 中。每个容器（包括分子）都有一个参数 Param A。

物理容器还有参数 Concentration。

以下示例展示了标签和容器条件的概念。它们并非旨在代表生理学上有意义的模型。

如果创建具有以下条件的求和公式：

匹配标签条件（Match tag condition）：当标签名称匹配时条件满足。
- 对于匹配标签条件"Param A"的求和公式，求和将包括以下参数：
  - Organism|Param A
  - Organism|Container A|Param A
  - Organism|Container A|Container A1|Param A
  - Organism|Container A|Container A1|Molecule A|Param A
  - Organism|Container A|Container A2|Param A
  - Organism|Container A|Container A2|Molecule A|Param A
  - Organism|Container B|Param A
  - Organism|Container B|Container B1|Param A
  - Organism|Container B|Container B1|Molecule A|Param A
  - Organism|Container B|Container B2|Param A
  - Organism|Container B|Container B2|Molecule A|Param A
不匹配标签条件（Not match tag condition）：当标签名称不匹配时条件满足。
- 对于参数 SumOfParameters，条件为 Not tagged with: Param A 和 Not tagged with: SumOfParameters（后者是避免循环引用所必需的），求和将包括以下参数：
  - Organism|Container A|Container A1|Volume
  - Organism|Container A|Container A1|Molecule A|Concentration
  - Organism|Container A|Container A2|Volume
  - Organism|Container A|Container A2|Molecule A|Concentration
  - Organism|Container B|Container B1|Volume
  - Organism|Container B|Container B1|Molecule A|Concentration
  - Organism|Container B|Container B2|Volume
  - Organism|Container B|Container B2|Molecule A|Concentration
- 以及分子量：
  - Organism|Container A|Container A1|Molecule A
  - Organism|Container A|Container A2|Molecule A
  - Organism|Container B|Container B1|Molecule A
  - Organism|Container B|Container B2|Molecule A
在容器中（In Container）：当实体位于指定容器及其子容器中时条件满足。
- 对于条件"In Container with: Organism"的参数，求和包括上面列出的所有参数和分子量（因为 Organism 是最顶层容器）。
- 对于条件"In Container with: Container A"的参数，求和将包括：
  - Organism|Container A|Param A
  - Organism|Container A|Container A1|Param A
  - Organism|Container A|Container A1|Volume
  - Organism|Container A|Container A1|Molecule A|Concentration
  - Organism|Container A|Container A1|Molecule A|Param A
  - Organism|Container A|Container A2|Param A
  - Organism|Container A|Container A2|Volume
  - Organism|Container A|Container A2|Molecule A|Concentration
  - Organism|Container A|Container A2|Molecule A|Param A
- 以及分子量：
  - Organism|Container A|Container A1|Molecule A
  - Organism|Container A|Container A2|Molecule A
不在容器中（Not in Container with）：当实体不在指定容器或其任何子容器中时条件满足。
在父容器中（In Parent）：当实体位于指定容器及其子容器中时条件满足。可以视为"In Container"的特例，其中容器是所考虑实体的父容器。
在子容器中（In Children）：当实体位于定义条件的实体的父容器的所有子容器中时条件满足。
- 对于位于 Organism|Container A 中条件为"In Children"的参数，求和将包括：
  - Organism|Container A|Container A1|Param A
  - Organism|Container A|Container A1|Volume
  - Organism|Container A|Container A1|Molecule A|Concentration
  - Organism|Container A|Container A1|Molecule A|Param A
  - Organism|Container A|Container A2|Param A
  - Organism|Container A|Container A2|Volume
  - Organism|Container A|Container A2|Molecule A|Concentration
  - Organism|Container A|Container A2|Molecule A|Param A
- 以及分子量：
  - Organism|Container A|Container A1|Molecule A
  - Organism|Container A|Container A2|Molecule A

可以组合多个条件进行求值；组合之间用逻辑 AND 或逻辑 OR 连接。何时以及如何输入标签条件的详细步骤在本章中描述（求和公式或运输过程）。

PK-Sim® 生成的模型大量使用标签：例如，打开 PK-Sim® 模型，查看 Passive Transports（被动运输）中名为"MassTransferBloodPool2OrgPl"的血液通过器官的质量转移过程。这是一个从动脉血浆隔室到所有器官（除肺外）血浆隔室的被动运输过程。因此，此运输过程在以下条件下发生：

源容器：标记有"Arterial Blood"和"Plasma"标签。
目标容器：标记有"Plasma"标签，且不标记有"Arterial Blood"标签，且不标记有"Lung"标签。

类似地，观察器或事件可以被包含或排除在空间结构不同部分中的创建。例如，分子观察器"Fraction excreted"（排泄分数）使用了"Urine"标签，因此此观察器仅在尿液容器中创建。

路径概念

模型结构中的实体（参数、分子量、容器、反应）通过其路径访问。路径是描述实体在模型结构层次中位置的字符串。路径元素由管道符 | 分隔。路径可以指定为绝对路径或相对路径。

绝对路径指定到引用对象的完整路径，例如 Organism|Bone|Volume。由绝对路径引用定义的别名将始终引用同一对象，无论公式在哪里使用。
相对路径引用指定实体相对于公式位置的路径。表达式 .. 表示"上一级"，使用类似文件系统路径的结构。例如 ..|..|Volume 就是一个相对引用。

关键字

引用路径可以包含以大写字母书写的通用关键字。支持以下关键字：

TIME：模拟时间。可在公式的任何位置使用。
MOLECULE：公式使用上下文中的分子。可用于分子、运输和观察器的参数中。
- 示例：被动运输过程动力学方程中的 Organism|Gallbladder|MOLECULE 将引用创建特定运输的分子的量。
SOURCE：运输过程的源容器。可用于运输过程的参数中。
- 示例：被动运输过程动力学方程中的 SOURCE|Volume 将引用运输过程源容器的体积。
TARGET：运输过程的目标容器。可用于运输过程的参数中。
- 示例：被动运输过程动力学方程中的 TARGET|Volume 将引用运输过程目标容器的体积。
NEIGHBORHOOD：公式使用上下文中的邻域。可用于邻域或运输过程的参数中。
- 示例：被动运输过程动力学方程中的 NEIGHBORHOOD|Surface area (plasma/interstitial) 将引用创建特定运输的邻域的表面积。
FIRST_NEIGHBOR：邻域的第一个容器。
SECOND_NEIGHBOR：邻域的第二个容器。
<NBH>：使用此关键字的语法为 <First Neighbor>|<NBH>|<Second Neighbor>|<NBH>，其中 <First Neighbor> 和 <Second Neighbor> 是存在邻域关系的两个容器的路径。
- 虽然 <First Neighbor> 可以是绝对或相对路径，但 <Second Neighbor> 始终相对于第一个邻居给出。
- 此关键字用于在不知道容器实际名称的情况下通用定义邻域路径。通常与其他关键字和相对路径组合使用。
- 示例：..|<NBH>|..|..|Interstitial|<NBH>|Surface area 用于位于器官细胞内空间的参数，例如 Organism|Kidney|Intracellular|ParameterA。此路径指向该器官细胞内空间与间质空间之间的邻域。具体来说：
  - 第一个 <NBH> 关键字之前的表达式 .. 向上一级，指定邻域的第一个邻居，例如 Organism|Kidney|Intracellular。
  - 第一个 <NBH> 之后的表达式 ..|..|Interstitial 定义第二个邻居。它向下降到器官级别，例如 Organism|Kidney，然后进入 Interstitial 容器，结果为 Organism|Kidney|Interstitial。
  - 第二个 <NBH> 标记邻域路径的结束。
REALIZATION：主动运输可以转化为 1 个或多个运输实现（见下图高亮部分）。实现可以有自己的参数，可以使用此关键字引用。

TRANSPORTER：主动运输过程中的转运蛋白分子。
TRANSPORT：引用全局运输过程。可用于检索运输过程的全局参数。
ALL_FLOATING_MOLECULES：表示对所有浮动分子的引用的字符串。该条目将被复制。通常用于事件赋值中一次性更改所有浮动分子。
LUMEN_SEGMENT：在 Lumen 下搜索与关键字前最后一部分同名的隔室。例如，对于定义在 Organism|SmallIntestine|Duodenum 中的参数，路径 ..|LUMEN_SEGMENT|Volume 将解析为 Organism|SmallIntestine|Lumen|Duodenum|Volume。
LUMEN_NEXT_SEGMENT：搜索 Lumen 中的下一段。假设公式用于 Organism|Lumen|Caecum 中的参数，路径 ..|LUMEN_NEXT_SEGMENT|P1 将解析为 Organism|Lumen|ColonAscendens|P1。这也适用于绝对路径：Organism|Lumen|Stomach|LUMEN_NEXT_SEGMENT|P1 将解析为 Organism|Lumen|Duodenum|P1。
LUMEN_PREVIOUS_SEGMENT：搜索 Lumen 中的前一段。假设公式用于 Organism|Lumen|ColonTransversum 中的参数，路径 ..|LUMEN_PREVIOUS_SEGMENT|P1 将解析为 Organism|Lumen|ColonAscendens|P1。这也适用于绝对路径：Organism|Lumen|LowerIleum|LUMEN_PREVIOUS_SEGMENT|P1 将解析为 Organism|Lumen|UpperIleum|P1。