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MoBi® 个体构建单元:物种特异性参数、功能概览与创建新个体详解

2026年8月19日 7点热度 0人点赞 0条评论

个体(Individuals)

个体构建单元(BB)包含描述生理学的物种特异性和个体特异性参数。表达谱是定义个体生理特性的参数路径和值的列表。

具体而言,个体 BB 包含的参数具有以下特征:

  • 仅存在于特定物种中:例如 Organism|Lumen|Duodenum|Thickness_p1 仅存在于人类物种中,但不存在于大鼠中;而 Organism|Lumen|Duodenum|Default thickness of gut wall 则存在于大鼠中但不存在于人类中。
  • 具有不同的物种特异性值:例如 Organism|Acidic phospholipids (blood cells) [mg/g] - RR 在不同物种中具有不同的默认值。
  • 在种群内存在变异:例如 Organism|Fat|Volume(脂肪体积)在不同个体之间存在差异。

为了方便查看,在空间结构编辑器中,可以通过在"显示来自个体的参数"(Show parameters from individual)下拉框中选择一个个体,来显示在个体 BB 中定义的参数。

空间结构视图——选择了个体
空间结构视图——选择了个体

从 PK-Sim 导入 PBPK 模型时,会自动创建一个新的个体。

与其他 BB 类型不同,个体 BB 不是模块的一部分,而是存储在 MoBi 项目浏览器的单独文件夹中。它们可以与项目的任何模块组合使用。在个体中定义但不存在于空间结构中的参数,将在模拟创建过程中自动创建。此行为与参数值 BB 类似。

个体——功能概览

打开个体 BB 后,编辑器显示两个选项卡:

  • 参数(Parameters):列出所有参数、它们的值和公式。此外,还显示物种和个体特征(如年龄、体重、身高)等元数据。

用户可以编辑参数值,但不能添加新条目或删除现有条目。若要为新结构(例如新器官)添加生理参数,需要在扩展模块中创建参数值 BB,并在其中添加新条目。

个体可以保存为 pkml 文件,并可作为参数值 BB 加载到扩展模块中。

创建新个体

在 MoBi 中,可以通过访问生理数据库来创建新个体。在 MoBi 项目浏览器中右键点击 Individuals 文件夹,选择 Add Individual(添加个体)。详细过程请参阅 创建个体 文档中的说明。

标签: 暂无
最后更新:2026年8月19日

MSxiaoming

得失从缘,心无增减

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