模型模拟 模型模拟简介 原理 根据参数，在不直接进行数学求解的情况下，预测药物的暴露和效应。 模拟计划 模拟过程需要注意的内容： 模拟患者特征是否与真实患者典型特征匹配 模拟场景可行性 研究设计的合理性 药动学和药效学指标合理性 基于目的，模型可以为包含个体变异群体模型，也可为不包含个体变异的群体模型 模拟 包括：协变量分布模型 ，输入输出模型，试验执行模型 一、协变量分布模型 考虑受试者特征：年龄、体重、病理、遗传、合并用药等 1. 抽样 从建模数据库或者公共数据库中抽取协变量分布特征。 2. 重采样 从原始数据…
@TOC 一 、群体药代动力学数据探索目的和方法 数据探索目的 建模前通过图法和统计学方法，对研究数据探索可揭示数据特征，发现明显趋势，辨识离群值，异常值等。 数据来源 数据来自于焦正主编的基础群体药动学和药效学书籍第10章第二节模型数据 方法 作图主要用ggplot2包，及代码中涉及的包。 作图所用主题为ggplot2默认主题：theme_bw() 稍调整 二、数据探索过程 PK数据探索 加载的包和设目录 代码： #加载的包---- library(ggplot2) library(dplyr) library(…
群体药动学药效学模型 一、药效学模型简介 明确药物暴露、药效和时间之间的关系。 经验性的药动学药效学模型包括了直接效应模型、效应室模型和翻转模型。机制性模型较经验性模型更为复杂，进一步考虑了药物的作用靶点、与临床终点 事件相关的标志物等因素。 二、常用的药动学药效学模型 直接效应模型 药效学直接效应模型可用来描述大多数药物的药动学和药效学之间的关系。表达式如下： $E_t=E_0+\frac{E_{\max } \cdot C_{\mathrm{p}, t}^\gamma}{E C_{50}^\gamma+C_{\…
ＮＯＮＭＥＭ软件可通过自定义方式，高度灵活地建立各种复杂的药动学药效学模型。 ＮＯＮＭＥＭ软件中既有内设的药动学模型（ＡＤＶＡＮ１、ＡＤＶＡＮ２、ＡＤＶＡＮ３、ＡＤＶＡＮ４、 ＡＤＶＡＮ１０、ＡＤＶＡ、ＡＤＶＡＮ１１和ＡＤＶＡＮ１２），也可采用非限定的ＰＲＥＤ及ＰＲＥＤＰＰ模块，自由定义房室数目、参数和相关函数关系式等，描述复杂的药动学和药效学行为。例如， 零级和一级的混合吸收、渐进吸收、非线性消除、自身诱导等。这些特殊药动学行 为难以用ＮＯＮＭＥＭ内置的ＡＤＶＡＮ模块直接进行表征。 下图表征了某一级消除的一房室模…
用到的包 library(dplyr) library(ggplot2) library(gridExtra) 加载资源 source("D:\\工作文档\\R\\col_function.r") 设置工作目录 setwd("C:\\Users\\Administrator.ADMIN-20170618T\\Documents\\demo-data\\PPK\\iv infusion 3cp") 读取数据 #read data---- SDTAB<-read.table("SDTAB1",sep="",ski…
诊断图 分类： 绘制诊断图是最为常见的一种模型评价方法，适用于基础模型和最终模型的比较与 评价。总体而言，模型诊断图可根据不同变量分为以下几种： 1. 基于预测的模型诊断图 2. 基于残差的模型诊断图 3. 基于贝叶斯估算的模型诊断图 不同的诊断图从不同的视角评估模型的准确性与适用性，反映了模型化过程中的模 型设定错误、违背随机变量分布假设以及离群值等问题。这些诊断图可并行比较，描述纳 入协变量前后模型的改善情况，以指导模型的开发与优化过程。 基于预测的模型诊断图 呈现实际观测值与群体、个体预测值的一致性，反映模型…
NONMEN 协变量模型 协变量的定义 描述药代动学和药效学的变异来源。协变量模型可 区分群体中可能无法达到药效或产生不良反应的亚群体；明确药动学和药效学行为的影 响因素；提高对药物作用机制的认识和模型的预测能力；也可进一步提出合理假说。 包括：性别、年龄、体重、体表面积、种族、实验室检测指标，疾病状态等 图解法 协变量和协变量之间的关系图 协变量和参数的相关性图 统计学检验原理 嵌套模型：当考察协变量效应时，所比较的模型须为嵌套模型（ｎｅｓｔｅｄｍｏｄｅｌ）。嵌套模型即模型 结构一致的模型。复杂模型比简单模型的参…
结构模型 结构模型：群体药动学模型中的结构模型是经典的药动学模型，如一级消除的一房室药动学模 型、一级吸收和一级消除的二房室模型等。结构模型的选择方法与经典药动学一致，可通 过绘制模型诊断图、统计学检验以及评估参数估算值的精密度等进行综合 评判，不能仅依赖于统计学检验。 结构模型可以根据药物的特征及数据的特点灵活地选择： 1. 如果所研究的药物的药动学特点已有文献报道，可以选用文献报道的药动学模型作为结构模型。 2. 若无现成的研究数据可以利用，可利用密集取样的数据，采用经典药动学方法拟合模型，初步判断结构模型。 …
NONMEN输出结果 最重要的输出文件lst文件 iv infusion 3cp\infusion_3cp.nm7\infusion_3cp.lst 简洁输出文件 iv infusion 3cp\infusion_3cp.nm7\infusion_3cp.smr 控制文件和软件授权信息 lst文件内 1. 完整运行的控制文件 2. 授权信息 License Registered to: XXXX ;购买软件许可的机构 Expiration Date: XXXX ;到期时间 Current Date: XXXX ;当…
NONMEN 控制文件简介 构建群体药动学药效学模型及估算参数时,须建立特定格式的控制文件｡ 控制文件是ASCII文本文件,可采用微软的记事本等文本编辑程序进行编写｡ 控制文件由一系列命令行构成｡每一条命令行或模块的起始以特定字符美元字符“$”开头｡ 此外,命令或模块名可使用完整名或前4个字符的缩写,如PROBLEM可用PROB代替｡ NONMEN 控制文件组成 每一条命令行或者模块以特定符号“$”开头，可缩写 控制文件主要由PROBLEM、DATA、INPUT、PRED、THETA、OMEGA、SIGMA、EST…
