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PBPK 能不能压缩成室模型:用 lumping method 读懂 PBPK、lumped 与 compartment model 的关系

2026年7月21日 14点热度 0人点赞 0条评论

摘要

这篇文章讨论一个很实用的问题:PBPK model 能不能被压缩成更简单的 compartmental PK model,以及这种压缩在真实药物案例中到底有多可靠。

作者用 lumping method 把全身 PBPK 模型中的多个组织和器官合并成 lumped model,再把它和传统 compartmental PK model 放在一起比较。研究对象不是一个模拟玩具例子,而是 20 个已经批准或已有文献模型的真实药物,覆盖不同清除、分布、治疗类别和 BDDCS 分类。

核心结论可以先记住一句:PBPK 到 lumped model 的压缩总体比较稳,尤其是 clearance 和 central exposure;但 lumped model 再对应到经验性 compartment model 时,peripheral compartment 的解释会变得不那么直接。

引言

PBPK 模型的优点是生理结构清楚:器官体积、血流、组织分配、代谢和排泄都可以显式写进模型。它适合解释机制、跨物种外推、特殊人群预测和 DDI 等问题。但 PBPK 也有一个现实缺点:参数多、结构复杂,很多时候不容易和临床常用的 compartmental PK model 对上。

compartmental PK model 则相反。它通常用一室、二室或三室结构拟合浓度-时间数据,参数更少,也更适合日常 NCA、PopPK 和暴露-效应分析。但它的 central compartment、peripheral compartment 并不是实际器官,更多是数学上的经验性合并。

这篇文章夹在两者之间,问的是:如果把 PBPK 的器官按动力学和生理相似性合并,得到一个 lumped model,那么这个中间模型能否帮助我们理解 PBPK model 和 compartmental model 之间的关系?

PBPK model, lumped model and compartmental PK model relationship
图 1 PBPK model 可以通过 lumping method 压缩成 lumped model,再与 compartmental PK model 的 central/peripheral 结构进行比较。

研究问题

文章的研究问题并不是“PBPK 和 compartment model 哪个更好”,而是更细一点:两类模型之间是否兼容,哪些 PK 量兼容,哪些地方不兼容。

作者主要比较三类指标:

1. 浓度-时间曲线和 AUC。 包括 PBPK central exposure、lumped central compartment、compartment model central compartment,以及 PBPK peripheral tissues、lumped non-eliminating tissues、compartment model peripheral compartment。

2. PK 参数。 重点看 clearance、central volume 和 peripheral volume。

3. 分布相关关系。 例如 Vd/fu 与 AUC accuracy,用来判断 lumped model 和 compartment model 的差异是否有系统性原因。

方法:从 PBPK 到 lumped model

lumping method 的基本思想很直观:如果多个组织在模型中承担相似的动力学角色,就可以把它们合并成一个较大的“合并组织”。但关键是合并不能随便加,要让血流、体积和组织分配这些量在数学上保持一致。

这篇文章中,arterial blood、venous blood 和 lungs 被合并成 lumped central compartment, LCEN。adipose、bone、brain、muscle、heart、rest of body 和 skin 等非消除组织被合并成 non-eliminating tissues, NET。liver、kidney 这类消除器官保留独立结构,spleen 和 gut 因为与 liver 的输入输出关系相关,也没有简单并入 NET。

合并后的体积和血流量用组织体积、组织血流量相加得到;合并后的 partition coefficient 则按组织体积加权计算。这样 lumped model 不是重新拟合出来的经验模型,而是从 PBPK 参数体系中推导出来的简化模型。

20 个真实药物案例怎么比较

作者选了 20 个 model compounds,尽量覆盖不同的 systemic clearance、volume of distribution、治疗类别和 BDDCS 分类。每个药物先基于文献 PBPK model 进行模拟,再转成 lumped model,并与 compartmental PK model 进行比较。

模拟部分使用 mrgsolve,NCA 参数计算使用 Phoenix WinNonlin。这里值得注意的是,作者并不是只看一条曲线像不像,而是把 central/peripheral AUC、CL、Vc、Vp 都拆开比较。这样的好处是能看出哪里只是表面曲线相似,哪里是真的参数含义接近。

结果:central exposure 与 clearance 最稳

central compartment 相关结果相对乐观。PBPK central compartment 与 LCEN lumped compartment 的 AUC 在 20 个药物中有 18 个落在 2-fold 范围内,比例为 90%。例外是 clozapine 和 amlodipine。

但当 LCEN lumped compartment 再和 compartmental PK model 的 central compartment 比较时,2-fold 范围内的药物变成 14/20,比例为 70%。例外包括 midazolam、telmisartan、paracetamol、artemether、fluoxetine 和 theophylline。这说明 PBPK 到 lumped 的理论压缩更稳定,而 lumped 到经验性 compartment model 的对应关系会受到拟合结构和数据特征影响。

clearance 是三类模型中最一致的参数。20 个药物里有 19 个在 PBPK、lumped 和 compartment model 之间保持 2-fold 内一致,只有 alfentanil 是例外。这个结果也符合直觉:CL 更接近系统总消除能力,通常比 peripheral volume 这类结构解释更稳。

peripheral compartment 的解释最要小心

peripheral exposure 的结果更有意思。PBPK 的各组织 AUC 与 NET lumped compartment 的 AUC 在 19/20 个药物中位于 2-fold 范围内,说明从 PBPK 合并到 NET 本身是可行的,只有 metoprolol 是明显例外。

但 NET 再和 compartmental model 的 peripheral compartment 比较时,差异明显变大。对于二室模型药物,多数案例中 NET 与 peripheral compartment 的 AUC 或体积并不能简单一一对应。这提示我们:传统二室模型里的 peripheral compartment 不能直接等同于 PBPK 中所有非消除组织的总和。

这点对建模解释很重要。PopPK 或 compartment model 里的 Vp 可能只是为了拟合曲线形状而存在,它反映的是混合的分布过程,并不一定能直接翻译成某一组真实组织体积或组织暴露。

AUC accuracy between lumped model and compartmental PK model
图 2 AUC accuracy 用于衡量 lumped model 与 compartmental PK model 之间的兼容性,整体有 15/20 个案例落在 2-fold 范围内。

快速对照表

比较对象 主要结果 我会怎么理解
PBPK central vs LCEN 18/20 在 2-fold 内 PBPK 压缩成 central lumped compartment 比较可靠
LCEN vs compartment central 14/20 在 2-fold 内 central 仍有较好对应,但不完全等价
PBPK tissues vs NET 19/20 在 2-fold 内 非消除组织合并本身大体成立
NET vs compartment peripheral 多数二室案例差异较大 peripheral compartment 更像经验拟合结构
CL 19/20 在三类模型间一致 清除参数最稳,跨模型解释相对安全
Vc / Vp PBPK vs lumped 较稳,lumped vs compartment 差异较多 体积分布参数要结合模型结构解释

为什么会有例外

例外案例提醒我们,lumping method 虽然漂亮,但不是万能压缩器。不同药物的组织分配、蛋白结合、血流限制、消除器官贡献、采样窗口和 compartment model 拟合策略都会影响最后的对应关系。

metoprolol、clozapine、amlodipine 等例外说明,当某些组织分配行为或模型结构更复杂时,简单的合并可能无法完全保留原 PBPK 模型中的暴露特征。alfentanil 的 CL 差异则说明,哪怕是通常稳定的清除参数,也可能受原始模型设定或 compartment model 估计方式影响。

我觉得这里最实用的态度是:lumped model 适合用来理解和诊断模型关系,不适合把所有 compartment 参数都强行赋予生理含义。

讨论

这篇文章最有价值的地方,是给 PBPK 和 compartmental PK model 之间搭了一座中间桥。以前我们常说 PBPK 更 mechanistic,compartment model 更 empirical,但实际工作中经常需要在两者之间切换:早期用 PBPK 做机制预测,临床数据出来后又用 compartment model 或 PopPK 做估计和沟通。

lumping method 提供了一种检查方式:如果 PBPK 简化成 lumped model 后仍能保留 AUC、CL 和关键体积关系,那么说明 PBPK 的主要动态行为比较稳定;如果 lumped model 和 compartment model 差异很大,就要进一步判断差异来自结构假设、参数估计还是数据本身。

文章也很诚实地写出了限制。这里的 PBPK 模型主要是 perfusion rate-limited tissue model,模拟场景也集中在单剂量和特定给药条件下。对于 permeability rate-limited tissue、复杂给药路径、多剂量稳态或特殊人群,是否仍能得到类似结论,还需要更多验证。

结论

如果把这篇文章压缩成一句话,我会写成:lumping method 可以把 PBPK 的生理结构压缩成可解释的中间模型,从而帮助判断 PBPK model 与 compartmental PK model 在 AUC、CL 和分布参数上的兼容性。

它最适合用来回答“这个 PBPK 模型的主要行为能不能被低维模型表达”,以及“compartment model 的参数能不能被谨慎地连接回生理结构”。但尤其对 peripheral compartment,解释时要留一层余地。

我的几点启发

1. PBPK 简化不是简单删器官。 合并组织时要保留体积、血流和分配系数的数学一致性,否则简化后的模型没有解释价值。

2. central exposure 和 CL 更适合跨模型比较。 这两个量在 PBPK、lumped 和 compartment model 之间最稳定。

3. peripheral compartment 不要过度生理化。 二室模型里的 peripheral compartment 很多时候是经验性结构,不能直接等同于一组真实组织。

4. lumped model 很适合做模型诊断。 它能帮助判断差异到底来自 PBPK 结构、组织合并方式,还是 compartment model 的拟合假设。

5. 对 PBPK 到 PopPK 的衔接很有启发。 如果后续要把 PBPK 预测、临床 PopPK 和剂量选择放在一起,lumping method 是一个很值得保留的中间解释工具。

标签: 暂无
最后更新:2026年7月21日

MSxiaoming

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